ChemBio3D Ultra是一款化學(xué)結(jié)構(gòu)式畫圖軟件，可以幫助用戶進(jìn)行分子式的繪畫，直接通過化學(xué)方程式，直接畫出分子的結(jié)構(gòu)，可以直接觀察3D分子模擬圖形，查看其3D結(jié)構(gòu)，適合于化學(xué)家與生物學(xué)家使用，研究化合物的結(jié)構(gòu)，預(yù)測(cè)化合物的屬性。

軟件功能

1、可視化建模

通過3D建模、可視化和計(jì)算等功能，科學(xué)家能夠更好、更快地確定出研究重點(diǎn)，從而提高生產(chǎn)力，快速達(dá)成研究目標(biāo)。學(xué)生則可以使用ChemBio3D Ultra官方版更加深入地認(rèn)識(shí)分子的3D空間結(jié)構(gòu)及對(duì)其屬性所產(chǎn)生的影響。

2、2D與3D模式結(jié)構(gòu)互換

ChemBio 3D集成ChemBioDraw，可簡(jiǎn)化2D和3D模式之間的結(jié)構(gòu)互換，科學(xué)家能夠研究小分子和生化制劑的三維形狀及屬性，并且使合成化學(xué)家與計(jì)算化學(xué)家之間的交流更有效和開放。

3、豐富的應(yīng)用接口

ChemBio 3D經(jīng)濟(jì)實(shí)用，充分滿足大多數(shù)科學(xué)工作者的需求，同時(shí)也能提供與其它應(yīng)用程序的接口，滿足用戶對(duì)更高級(jí)功能的需求。這款程序在普通桌面系統(tǒng)上即可運(yùn)行，無需配備高性能和高端制圖功能的系統(tǒng)。

4、兼容多款程序、準(zhǔn)確預(yù)測(cè)結(jié)果

ChemBio 3D包括多個(gè)可選版本，如半經(jīng)驗(yàn)建模程序MOPAC、半經(jīng)驗(yàn)和從頭開始的Gaussian分子軌道計(jì)算，并可連接到從頭計(jì)算程序GAMESS以及可處理柔性配體的自動(dòng)對(duì)接程序AutoDock。

軟件特色

3D眼鏡

(W)包括眼鏡提供增強(qiáng)的立體聲模式與深度的陰影，給現(xiàn)實(shí)的三維效果圖質(zhì)量的所有結(jié)構(gòu)。(包括在光盤購買而已。)

自動(dòng)覆蓋

(W)選擇多個(gè)分子結(jié)構(gòu)，自動(dòng)對(duì)齊靶分子。

ChemDraw盜鏈

(W)同時(shí)2D和3D編輯!使用ChemDraw窗口嵌入在Chem3D畫結(jié)構(gòu)的應(yīng)用。這個(gè)強(qiáng)大的功能，增加了一個(gè)二維視圖，總是在3D視圖同步。

chemprop

(W)先進(jìn)的性能參數(shù)包括BP、MP和更多。

ClogP

(W)ClogP產(chǎn)權(quán)服務(wù)器提供計(jì)算的正辛醇/水分配系數(shù)的新方法。

二面角驅(qū)動(dòng)

(W)新的構(gòu)象分析工具允許MM2能量圖的生成。

增強(qiáng)的圖形

(W)c hem3d使用OpenGL提供高質(zhì)量的圖形顯示。

正式指控

(W)分配形式電荷原子和結(jié)構(gòu)將產(chǎn)生離域自動(dòng)充電。

GAMESS接口

(W)結(jié)構(gòu)的界面會(huì)。

組標(biāo)簽

(W)在結(jié)構(gòu)模型視圖顯示組的標(biāo)簽。

氫鍵

(W)自動(dòng)顯示氫鍵在3D視圖!

凱庫勒/異于尋常的顯示模式

(W)之間的虛線和交替的離域和芳香鍵單雙鍵表示切換。

邏輯

計(jì)算分配系數(shù)D值的對(duì)數(shù)，這是所有形式的化合物的濃度之和的比值(電離和非離子化)在一個(gè)階段。

日志

計(jì)算一個(gè)化合物的溶解度值的對(duì)數(shù)。這個(gè)值顯著影響其吸收和分布特征。

mm2

(W)內(nèi)置mm2生成逼真的三維結(jié)構(gòu)的支持。

MMFF94

(W)MMFF94是分子力學(xué)力場(chǎng)支持有機(jī)分子和生物大分子。MMFF94力場(chǎng)提供更豐富的原子類型設(shè)置為。使MMFF94計(jì)算多處理器支持。

模型資源管理器

(W)為探索大型模型的分層樹結(jié)構(gòu)的控制。進(jìn)口PDB文件和檢查鏈，組，和配體。這個(gè)新功能提供了細(xì)粒度的控制。

分子建模與動(dòng)力學(xué)

(W)工作站質(zhì)量的分子模擬。

MOPAC接口

(W)接口的異構(gòu)結(jié)構(gòu)。(注：MOPAC應(yīng)用要求。見應(yīng)用包括部分澄清。)

支援多重處理器

使MMFF94計(jì)算多處理器支持。

局部表面

(W)生成和顯示對(duì)蛋白質(zhì)的活性位點(diǎn)的局部表面。

PKA

計(jì)算出的酸離解常數(shù)Ka值的對(duì)數(shù)，這就是溶液中酸的強(qiáng)度的定量測(cè)量。

幻燈片演示文稿軟件

(W)嵌入結(jié)構(gòu)模型在PowerPoint文件。旋轉(zhuǎn)和縮放結(jié)構(gòu)模型演示文稿時(shí)。

保存到Dropbox

使用云存儲(chǔ)通過Dropbox保存在一個(gè)安全的可共享的云的位置共享和進(jìn)口chembio3d模型。

Schr dinger捷豹ö接口

(W)接口ö薛定諤薛定諤Chem3D捷豹，從頭計(jì)算軟件包。(注：捷豹的應(yīng)用要求。見應(yīng)用包括部分澄清。)

光譜分析儀

(W)顯示來自捷豹，高斯譜的計(jì)算結(jié)果，并會(huì)在單獨(dú)的窗口中的圖形顯示。

隨機(jī)構(gòu)象分析

使用隨機(jī)構(gòu)象跳躍法測(cè)定分子的低能量極小。

結(jié)構(gòu)瀏覽器

(W)可以讓用戶輕松瀏覽一系列的小分子和比較它們的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)。