MaxQuant是一款蛋白質譜分析軟件，可能不少的從事化學研究相關領域的用戶可能會需要使用這個軟件進行學習或者是工作，實際上在這個軟件之中有著原始數據、組特定參數、全局參數、性能和可視化、組態等應用功能，用戶可以選擇自己所需要的功能進行使用，感興趣的用戶不要錯過了。

軟件功能

1、MaxQuant軟件提供蛋白質分析功能。

2、可以將實驗參數加載到軟件分析。

3、可以添加單一的數據參數執行分析。

4、也可以通過數據組合的方式完成分析。

5、擁有多種組態方案，可以快速建立下一個分析方案。

6、支持FTMS M / S匹配容差，支持FTMS去同位素。

7、也可以編輯FTMS MS / MS去偏差公差單位。

軟件特色

1、用于分析大型質譜數據集的定量蛋白質組學軟件包。

2、用于LC-MS/MS質譜測序數據的標量及非標量蛋白數據庫搜索及分析。

3、針對高分辨率的MS數據，支持多種定量標記技術及非標定量。

4、支持原始數據、組特定參數、全局參數、性能、可視化、組態。

5、也支持在軟件上查看 Six frame translation、氨基酸、UniProt sequence extraction。

使用說明

1、打開MaxQuant軟件，啟動以后進入分析界面，

2、分析的時候需要將原始數據打開，點擊load就可以進入數據查看界面，

3、也可以選擇特定的生物實驗數據組合打開，選擇建立多個分析實驗組，

4、可以在下方設置全局參數，這里有很多可以選擇的模式例如 MS/MS-TMS ，MS/MS-Unknown，

5、點擊 MS/MS- TOF，可以在左邊找到很多編輯的項目，

6、支持TOF MS / MS去異位耐受性、支持TOF MS / MS去偏差公差單位，

7、也可以選擇數據可視化，將生物實驗的數據顯示在圖表，

8、在工具界面上可以找到氨基酸信息，

9、打開以后出現下列數據，可以在這里查看氨基酸的相關數據。