gephi是一款簡單實用的網絡分析軟件，該軟件基于JVM制作，可以幫助用戶們在各種網絡和復雜系統對數據、鏈接、社交網絡進行分析，讓用戶們可以輕松獲取自己所需的內容，此外軟件還可以支持Windows, Mac OS X以及Linux多個平臺。

軟件功能

1、Gephi 是一款網絡分析領域的數據可視化處理軟件，其目標是成為 “數據可視化領域的 Photoshop”。

2、Gephi是一款開源的交互式的復雜網絡分析平臺。

3、它支持Windows, Mac OS X以及Linux等環境。主要功能包括：

4、Gephi被用于互聯網，生物醫學，交通網絡分析等各個領域。

5、Gephi 是一款開源免費跨平臺基于JVM的復雜網絡分析軟件, 其主要用于各種網絡和復雜系統，動態和分層圖的交互可視化與探測開源工具。

6、可用作：探索性數據分析，鏈接分析，社交網絡分析，生物網絡分析等。

7、Gephi 是一款信息數據可視化利器。

8、Gephi 可以供大學研究項目數據分析使用，新聞工作者，統計研究，微博信息研究等。

9、Gephi 是進行社交圖譜數據可視化分析的工具，不但能處理大規模數據集并生成漂亮的可視化圖形，還能對數據進行清洗和分類。

10、Gephi是一種非常特殊的軟件，也非常復雜，先于他人掌握Gephi將使你一騎絕塵。

操作說明

數據處理

以CSV格式文件為例：

邊文件（(edge)：前兩列為節點ID，另一列為相關系數。

節點文件(node)：一列節點ID，一列節點類型

導入數據

當然你要打開Gephi。【文件】→【打開】選擇文件，在點擊下一步的同時注意一下每個參數的含義是不是你要表達的意思。分別導入節點文件與邊文件。

輸入第二個文件時 注意：

設置布局樣式

Gephi提供多種布局方式，一般圓形網絡圖選擇”Fruchterman Reingold”布局格式。點擊【運行】，等布局穩定后，點擊 【停止】，生成圓形布局的網絡圖。

網絡拓撲參數計算

點擊【窗口-統計】面板，分別點擊 【運行】-【關閉】當然你也可以選擇打印、復制，保存，最終你還是要選擇關閉。進行以下6個拓撲參數的計算:平均度、網絡直徑、圖密度、模塊化、平均聚類系數、平均路徑長度。

注：對于無向網絡圖，平均度和平均加權度 數值相同。再次注意：可能會卡。

節點設定

點擊【窗口】-【外觀】-【節點】-大小-數值設定，選擇渲染方式為 度，設置節點大小的 最大尺寸和最小尺寸（此處分別為20和70），點擊 應用。顏色設置也在外觀節點中，設置渲染方式為Modularity Class注意紅色方框里內容，從左到右依次為：顏色、大小，標簽顏色、標簽尺寸。

邊設定

在【外觀】中選擇【邊】Partition 渲染方式選擇pn即我們數據中相關性標簽；Ranking選擇【度】。如下：

預覽修飾

點擊預覽，修改如下圖紅色方框選項，在 預覽設置 面板對網絡圖進行輸出前的最后修飾。

邊框寬度：設為0.0，不顯示節點邊框。

顯示標簽：打勾，顯示節點標簽。

字體：此處修改為 Times New Roman 23號 加粗

縮短標簽：打勾，不然標簽會過長導致相互覆蓋。

厚度：根據顯示需要修改邊線厚度，此處改為5。

重新調整權重：打勾，根據邊線權重顯示不同厚度。

另外的選項可根據需要自行調整。在之前的設置中也可以通過預覽來查看效果，一步一步調整。

圖像導出

Gephi 支持多種格式的輸出：SVG、PNG、PDF、gexf圖文件等。

節點：相同顏色是同一個門；節點大小表示連接度；

邊：紅色正相關，藍色負相關（spearman），粗細表示相關系數絕對值大小；

導出的矢量圖可用AI等圖形編輯軟件進一步修改，圖形文件也可以用腳本來處理，圖個性化地添加圖例等。圖文件也是一種標簽語言。

更新日志

1.修復已知bug

2.優化操作體驗