Arlequin是一款數(shù)據(jù)分析工具,使用這款軟件可以針對人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,支持AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等功能。需要的用戶快來下載看看吧。
軟件介紹
Arlequin官方版是一款專業(yè)的人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件,通過對統(tǒng)計數(shù)據(jù)中信息的挖掘,可進(jìn)行AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等,為從事醫(yī)學(xué)和生物學(xué)研究的朋友提供了參考方案,比較遺憾的是軟件沒有漢化版,使用起來可能稍微有些吃力!
軟件功能
1、Molecular diversity(分子多態(tài)性)
2、Mismatch distribution(錯配分布)
3、Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計)
4、Linkage disequilibrium(連鎖不平衡:檢測不同位點上等位基因的非隨機(jī)關(guān)聯(lián))
5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)
6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗)
7、Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗)
8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗)
以上三個中性檢驗都是基于無限位點模型,適用于DNA sequence 和 RFLP單倍型。
9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗,檢測人群的均一性或同質(zhì)性和中性選擇等)
10、Minimu Spanning Network(MSN,最小擴(kuò)張樹或稱之為最小支撐樹,,基于分子差異)
11、AMOVA 分子差異度分析,用以評測人群的遺傳結(jié)構(gòu)
12、Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計)
13、Exact test of population differentiation (檢測隨機(jī)交配群體單倍型的非隨機(jī)分布)
14、Assignment test of genotype (通過估計等位基因頻率將單個基因型分配到特定的人群中)
標(biāo)簽: 數(shù)據(jù)分析 遺傳學(xué)研究

數(shù)據(jù)分析是在各行各業(yè)都非常重要的環(huán)節(jié),通過數(shù)據(jù)分析工具,可以將有用的信息提取出來,對其進(jìn)行統(tǒng)計和處理,并且可以數(shù)據(jù)可視化,從而更加便捷的將其展示出來。那么數(shù)據(jù)分析軟件哪個最好用呢,在這里小編給大家整理了市面上主流的數(shù)據(jù)分析工具。
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