生物基因分析Gene Runner是一個(gè)專業(yè)的應(yīng)用，為遺傳學(xué)家和生物學(xué)家提供了可靠的工具，可以幫助他們進(jìn)行基因分析提供方便。

軟件介紹

Gene Runner 是一款專業(yè)實(shí)用的生物基因分析工具。它能夠幫助實(shí)驗(yàn)室工作人員的基因進(jìn)行數(shù)據(jù)模擬分析，讓數(shù)據(jù)能夠可視化提供我們查看，支持多種序列分析，您可以在一個(gè)界面上模擬不同組的序列，利用顏色以及圖形的方式區(qū)別基因組的變化過程。

軟件特點(diǎn)

1、查找：在此框中輸入查詢序列。查詢序列可能包含IUPAC通配符。堿基或氨基酸總數(shù)顯示在查詢框右側(cè)的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v鍵從剪貼板粘貼查詢序列(打開對(duì)話框窗口時(shí)，不能使用菜單中的編輯粘貼)。這個(gè)發(fā)現(xiàn)只接受一個(gè)字母的氨基酸代碼。在一個(gè)或三個(gè)字母的代碼顯示中可以找到合適的氨基酸。如果find以前用于當(dāng)前序列，請(qǐng)鍵入以前搜索的文本。每個(gè)序列都有自己的查找內(nèi)存。

2、標(biāo)準(zhǔn)是對(duì)在“查找：”框中輸入的查詢序列的正常搜索。用于簡(jiǎn)單搜索或核酸搜索，所有堿基/氨基酸必須完全匹配。

3、主題：當(dāng)搜索設(shè)置為蛋白質(zhì)時(shí)，單擊向下箭頭顯示Prosite主題的下拉列表。有關(guān)prosite及其序列約定的說明，請(qǐng)參見下文。當(dāng)設(shè)置為核酸時(shí)，將顯示核酸基序列表。選擇所需的主題。然后，Motif會(huì)自動(dòng)輸入find:框中。此特征允許識(shí)別TATA盒、AP1結(jié)合位點(diǎn)、N-糖基化位點(diǎn)等。

4、類型：確定執(zhí)行的搜索類型：標(biāo)準(zhǔn)、主題或不匹配。

5、motif是在motif框中搜索查詢序列，或使用prosite約定在find:框中輸入的序列，請(qǐng)參見下文。蛋白質(zhì)和核酸的基序可以以相同的慣例輸入。注意：此搜索比標(biāo)準(zhǔn)搜索慢。

軟件特色

基因的運(yùn)動(dòng)員是專業(yè)的應(yīng)用旨在提供遺傳學(xué)家和生物學(xué)家提供一個(gè)可靠的工具，可以幫助他們輕松地進(jìn)行基因分析。

發(fā)現(xiàn)限制性位點(diǎn)

酶限制圖方法位于更多方法菜單中，使您能夠創(chuàng)建限制性映射。

在確定限制位點(diǎn)后，可以通過選擇瓊脂糖凝膠模擬命令來預(yù)測(cè)瓊脂糖凝膠的限制性片段的電泳分離。在查看模擬凝膠時(shí)，您可以將光標(biāo)移到任何片段上，以顯示其范圍、大小和限制切割每個(gè)末端的限制酶的頭。

應(yīng)用程序需要的格式文件所包含的遺傳信息，然后可以使用“ORF分析”（開放閱讀框）按鈕，可以讓用戶設(shè)置優(yōu)先核苷酸或氨基酸的大小，以及選擇工作表的翻譯。開放的ORF的項(xiàng)目后，用戶可以對(duì)每個(gè)條目進(jìn)行各種注釋。

矩陣模式

這種方法，位于更多的方法部分，發(fā)現(xiàn)序列特征，如起始位點(diǎn)，剪接受體位點(diǎn)和剪接供體位點(diǎn)。矩陣模式是在單獨(dú)的數(shù)據(jù)文件中定義，Gene Runner軟件\矩陣式文件夾（MAC）。而由密碼子預(yù)測(cè)方法確定的起始密碼子是簡(jiǎn)單框架ATGs，矩陣模式方法考慮局部序列與預(yù)測(cè)功能的子集為ATGS起始密碼子的目的。

允許你同步更新兩個(gè)工作在相同的文件在任何或所有五lasergene應(yīng)用在同一時(shí)間。這樣的變化在一個(gè)應(yīng)用程序?qū)⒆詣?dòng)應(yīng)用的兩個(gè)相同的共享數(shù)據(jù)的其他應(yīng)用程序。

開放和節(jié)省開允許你在任何序列文件的命名和保存應(yīng)用以上文件的格式，這是usable市“任何的其他應(yīng)用程序。

“限制性分析”功能的基因流道，用戶只需檢查的序列的一部分，通過進(jìn)入優(yōu)選的切位點(diǎn)。此外，他們可以分析所有的酶的類型或復(fù)發(fā)/非回文。此功能還提供了用戶設(shè)置一個(gè)精確的分析區(qū)域和丟棄出挑的選項(xiàng)。